2001年设立医学检验五年制本科专业，2005年成立医学检验系，同年获批“临床检验诊断学”硕士学位授权点，2011年开始在四川省一本招生。2013年、2014年、2020年及2022年相继获批四川省教育厅“本科专业综合改革试点”专业、“国家住院医师规范化培训基地”、四川省“一流本科”专业建设点及国家“一流本科”专业建设点。

医学检验系采用系科合一办学模式，设临床生物化学、临床检验基础、临床免疫学、临床分子遗传、临床微生物五个教研室。拥有7000余平方米的临床教学用房和价值9000余万元的临床及实验教学设备，包括血液分析流水线、生化免疫流水线、尿液分析流水线、血药浓度监测仪、全自动细菌鉴定仪、实时荧光分析仪、测序仪、全自动染色体核型扫描仪、染色体核型FISH分析系统、流式细胞仪、数字PCR仪、MALDI-TOF质谱仪、HPLC-MS/MS串联质谱仪等。自主研发的具有专业特色的全息条形码医学检验信息系统和实验室试剂全程管理系统，设立国内首创的检验咨询(系统)门诊，负责检验报告的解释和检验咨询服务。拥有国家高科技计划(863)重点项目“生物医学关键试剂”实验室、西门子中国区示范实验室、泸州市临床检验中心、泸州市临床检验质量控制中心等实验室，是泸州市医学检验专委会主任委员单位。

医学检验系现有在读研究生40余人，本科生396人。现有教师60余人，其中教授、副教授23人；博士7人，硕士38人；博士生导 师1人，硕士生导师9人，国家(省级)专委会主任委员、副主任委员共6人；四川省学术和技术带头人后备人选3人，四川省卫健委学术技术带头人及后备人选2人。

医学检验系已逐渐形成医理交叉学科下衍生与拓展的协同育人机制，对传统的检验教学模式持续优化和转型，在教学内容、实践环节、课程改革等进行连续改革，从专业认知、技能知识到职业素养对学生进行综合培养，构建了适用于医疗、IVD的应用复合型人才培养模式，毕业生质量在区域内有很高的社会声誉，在行业内发挥了良好的桥梁骨干作用。

医学检验系已形成4个稳定研究方向：分子肿瘤学与肿瘤的分子诊断、输血医学、生物标志物检测新方法及应用机制研究、临床生化室内质量控制、代谢性疾病的研究。该团队先后主持国家自然科学基金(含青年基金)4项，四川省科技厅项目近20项，市厅级项目40余项，发表SCI 论文50余篇，核心论文100余篇，申请国家发明专利(含实用新型)30余项，其中授权10余项，主编或参编国家级、省级教材5部。2011年获泸州市科技进步奖特等奖，2012年获四川省科技进步奖三等奖，2019年获四川省医学科技进步奖二等奖、四川省医学科技进步奖二等奖(青年),2020年获四川省科技进步奖二等奖，2021年获中华医学会医学科学技术奖三等奖。