儿科学专业起源于2002年临床医学儿科专业方向，2016年教育部批准为本科专业，2017年成立儿科学系。现为临床医学博士点儿科博士培养单位、儿科学本科专业及儿科学、小儿外科学、新生儿重症护理硕士学位授权单位。2017年、2020年先后与澳门科技大学、暨南大学联合培养博士研究生，2022年开始招收“儿科学”专业学位博士研究生。目前是国家级新生儿围产期专科医师、儿科住院医师培训基地，国家首批小儿血液病定点医院，四川省首批临床重点专科，四川省新生儿特色保健专科，四川省小儿外科住院医师规范化培训基地，四川省出生缺陷临床医学研究中心，四川省危重新生儿救治中心、四川省小儿先心病治疗定点医院，四川省残疾儿童手术矫治定点和负责单位、四川省留守儿童矮身材天使童行基金免费救助定点医院、四川省医学会儿科学专业 委员会主任委员单位，四川省小儿外科医师协会候任会长单位。

全系有教授15人，副教授27人，教师队伍中90%以上具有硕士学位或博士学位，其中博士17人，硕士76人，博士生导师3人，硕士生导师13人。担任全国和省市学术团体职务18人，其中中华医学会儿科学分会全国委员1人及学组委员4人；中华医学会小儿外科学会委员2人，肛肠委员1人；中国医师协会儿科医师分会、新生儿科医师分会全国委员2人；中国妇幼协会微创学会委员3人。享受国务院特殊津贴的专家2人、四川省学术技术带头人3人、四川省学术技术后备人才3人，四川“天府青城计划”天府名医2人。分别担任《中国当代儿科杂志》《中华实用儿科临床杂志》《中华新生儿科杂志》《临床儿科杂志》《中国小儿血液与肿瘤》《西南医科大学学报》《国际输血及血液学》等二十余种杂志编委。近五年承担各级科研项目50余项，其中国家自然科学基金3项，国家卫健委基金1项，省部级课题15项；获四川省人民政府科技进步三等奖1项，四川省医学科技进步二等奖3项；发明专利16项；主编或参编教材和专著15部。近5年发表论文150余篇，其中SCI收录80余篇。